首先，在职研究生和全日制研究生最主要的区别就是上课方式，在职研究生主要是利用周末节假日的业余时间，进行非脱产式学习。而全日制研究生的上课时间都是周一至周五，进行脱产式学习。
其次，在职研究生上课多将理论与实践相结合的形式，让学员对于所学知识应用到实践当中，更好的解决实际工作中遇到的问题。而全日制硕士教学更重视理论书本知识，可能会与实际生活较脱节
最后，在职研究生有非学历教育，如同等学力申硕，考生最终获得硕士学位证书，学历上不会改变，只会提升学位。而全日制研究生为学历教育，考生可获学历学位双证证书。但在职研究生和全日制研究生所获证书的含金量都是相同的，受国家认可，考生可放心报考。在职研究生和全日制研究生有着一定的区别，但是目前，在职研究生是目前最适合在职人员深造学习的方式，不耽误工作，又可以提升学位，回报率极高。